犬の遺伝性難聴の遺伝学を探る

犬の遺伝性難聴は白色色素と関連しています。

これは次によって制御されます。 斑点のある 20番染色体上の遺伝子座と メルル これは複雑な形質であり、これまでの研究では、遺伝のメカニズムや根底にある遺伝子変異を特定できていませんでした。

いくつかの品種クラブや財団の献身と支援のおかげで、Dog Magazine Canine Health Foundation は犬のこの病気の研究に資金を提供しました。 (CHF Grant 02172-MOU:犬の遺伝性難聴の理解およびCHF Grant 02387-MOU:犬の遺伝性難聴 – 完全な兄弟ペアを使用したイングリッシュセッターのゲノム研究)。

ルイジアナ州立大学の研究者らは、遺伝性難聴に関連する遺伝子を探すために、502頭のダルメシアン、オーストラリアン・キャトル・ドッグ、イングリッシュ・セッターのDNAサンプルに対してゲノムワイド関連研究(GWAS)を実施した。

で結果が発表されました プロスワン1 は、聴覚障害と有意に関連する遺伝子変異を 1 つだけ明らかにしました。そして、それはデータ分析が両側聴覚障害者と正常なオーストラリアン キャトル ドッグに限定された場合にのみ特定されました。

他の 14 の変異は難聴との関連を示唆していましたが、潜在的な変異はそれぞれ研究された 3 品種のうちの 1 つに固有であり、これらの変異はいずれも難聴を含む染色体上には存在しませんでした。 斑点のある 軌跡。 これらの発見は、犬の先天性色素関連難聴が複雑な形質であり、追加のエピジェネティック因子や転写因子の影響を受ける可能性があることを裏付けています。

「干し草の山の中の針」の探索を支援するために、研究チームは人工知能に目を向けました。 STRING (Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes/Proteins) は、タンパク質間の相互作用のオープンアクセス データベースです。 このデータベースには、5,000 の異なる生物に見られる約 2,500 万のタンパク質の物理的および機能的相互作用に関する情報が保存されています。

研究者らは、STRING データを使用して、聴覚または色素に関連する経路と構造に焦点を当て、難聴に関連する可能性がある遺伝子のリストを絞り込みました。 彼らは、難聴に関連する可能性のある遺伝子を 100 個以上特定し、探索を続けるための妥当な標的を提供しました。2

これらの研究は、犬の遺伝性難聴は白色色素と関連しているものの、複数の要因の影響を受ける非常に複雑な形質であることを示しています。 難聴の根底にある遺伝子変異も各犬種に特有である可能性があり、この症状のメカニズムを理解するという私たちの探求をさらに複雑にしています。

参考文献:

  1. ヘイワード、JJ、ケリースミス、M.、ボイコ、AR、バーマイスター、L.、デリシオ、L.、メラーシュ、C.、フリーマン、J.、ストレイン、GM (2020)。 3 品種のイヌにおける難聴に関するゲノムワイド関連研究。 プロスワン、15(5)、e0232900。
    https://doi.org/10.1371/journal.pone.0232900
  2. ケリー・スミス、M.、ストレイン、GM (2020)。 STRING 犬の遺伝性色素関連難聴における GWAS データのデータマイニング。 獣医学および動物科学、100118。
    https://doi.org/10.1016/j.vas.2020.100118